WebMay 31, 2016 · GROMACS轨迹周期性边界条件的处理. 使用GROMACS完成模拟后, 有时需要对轨迹的周期性边界条件 (PBC)进行处理. 可能的目的主要有两个: 为了观看轨迹时分子保持完整, 不产生断键或过长的键, 同时未解离的复合物保持在一起; 为了对选定的中心分子进行居中, 以便进行 ... Web在我刚开始做模拟的时候, 我老板说别的你可以不知道, 有几个原则必须烙在你的脑子里, 稍一不注意就会完犊子. 其一是我们能模拟的体系\元胞\盒子非常非常小, 比你想象中的最小的还要小; 其二是我们能模拟的时间跨度…
如何理解微分方程数值解中的周期性边界条件? - 知乎
Web周期性边界条件 (Periodic Boundary Conditions, PBC)是边界条件的一种,反映的是如何利用边界条件替代所选部分 (系统)受到周边 (环境)的影响。. 可以看作是如果去掉周边环境,保持该系统不变应该附加的条件,也可以看作是由部分的性质来推广表达全局的性质。. 赞同 3. WebApr 10, 2024 · 周期性边界条件(PBC)是一组边界条件,通常通过使用称为单位单元的一小部分来选择它们,以近似大型(无限)系统。. PBC通常用于计算机仿真和数学模型中。. 二维PBC的拓扑与某些视频游戏的世界地图的拓扑相同。. 晶胞的几何形状满足完美的二维平 … nwsb cd rates
如何通俗地理解「周期性边界条件」,它设定的原理是什 …
WebMay 23, 2016 · 文档标签:. COMSOL周期性边界条件的应用在将真实的物理问题转化为仿真模型时,为了通过有限的计算资源获得尽可能高的计算精度,模型简化是必要的。. 模型简化的前提是所模拟的物理问题具有结构、材料属性及边界条件的对称性或均匀性,以此为基 … Web21 人 赞同了该回答. @ 知识库. 周期性边界条件的起源是因为大自然充满了周期性。. 最为简单的一个就是将某个物体绕轴旋转360°呈现出的周期性。. 出于把这个物体说的明白点的缘故,我们从偏微分方程的引入开始。. 众所周知: 事物之间的联系是相互的,A ... WebMar 2, 2024 · vmd笔记. yikes · 2024年03月02日 · 224 次阅读. 目录. 什么是 VMD?. [1] VMD is a molecular visualization program for displaying, animating, and analyzing large biomolecular systems using 3-D graphics and built-in scripting. VMD 官网的图片示例展览. 本文定位 :本文不适合作为入门教程,适合于在进阶 ... nwsb coudersport pa